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检测废水系统中氨氧化菌群落结构和丰度的方法

1017   编辑:管理员   来源:北方有色网  
2023-03-19 02:27:11
本发明公开一种检测废水系统中氨氧化菌群落结构和丰度的方法,具体步骤包括:(A)提取废水系统活性污泥中微生物的全部基因组DNA;(B)以全部基因组DNA为模板,以序列号为SEQIDNo.1的amoA1F和序列号为SEQIDNo.2的amoA2R为引物进行PCR扩增;(C)以罗氏454焦磷酸测序法对扩增产物进行测序,对测序结果运用Mothur程序划分操作分类单元,选择操作分类单元中具有99%相似度的代表性序列与数据库GenBank中公开序列进行在线BLASTn比对,根据比对结果划分系统进化树,得到氨氧化菌的群落结构分布和丰度;本发明操作简单、成本低廉、检测迅速、序列分析准确度高,能够定性分析氨氧化菌的不同群落结构组成,定量分析氨氧化菌不同种属的丰度,并且可同时对多个样品分析,具有较强的实用性,易于推广应用。
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